Terminal de Pasajeros
La terminal de pasajeros del Aeropuerto Toncontín concentra exclusivamente operaciones de cabotaje y servicios chárter tras el traslado de los vuelos comerciales internacionales al Aeropuerto Internacional de Palmerola.
Mostradores de facturación (Hall principal)
- Aerolíneas Sosa: La Ceiba, Roatán.
- Aviatsa: Opera vuelos no regulares (chárter) y traslados turísticos hacia Roatán y otros puntos del territorio hondureño.
- CM Airlines: Puerto Lempira, Roatán, San Pedro Sula.
Los vuelos comerciales de itinerario internacional que antiguamente despegaban de Tegucigalpa operan en su totalidad desde el Aeropuerto Internacional de Palmerola (XPL), situado en el valle de Comayagua.